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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  32 lines
  1. ************************************************
  2. * 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase signature *
  3. ************************************************
  4.  
  5. 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (EC 1.1.1.31) catalyzes the  NAD-dependent,
  6. reversible oxidation of 3-hydroxbutyrate to methylmalonate [1].  In eukaryotes
  7. it is a homodimeric mitochondrial protein  involved in valine catabolism.   In
  8. Pseudomonas aeruginosa  [2]  (gene  mmsB); it is involved in the distal valine
  9. metabolic pathway.
  10.  
  11. The sequence   of   3-hydroxyisobutyrate  dehydrogenase  from  eukaryotic  and
  12. prokaryotic sources  show  that this enzyme has been well conserved throughout
  13. evolution. Two  Escherichia  coli  hypothetical  proteins (yhaE and yihU) have
  14. sequences that   are   highly   similar   to   that   of  3-hydroxyisobutyrate
  15. dehydrogenase [3].
  16.  
  17. As a  signature  pattern  we  selected  a highly conserved glycine-rich region
  18. located at  the  the  N-terminus  of  these  proteins. This region is probably
  19. involved in the binding of NAD.
  20.  
  21. -Consensus pattern: F-[LIVM]-G-L-G-x-M-G-x-P-M-[SA]-x-N-L
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24. -Last update: October 1993 / First entry.
  25.  
  26. [ 1] Rougraff P.M., Zhang B., Kuntz M.J., Harris R.A., Crabb D.W.
  27.      J. Biol. Chem. 264:5899-5903(1989).
  28. [ 2] Steele M.I., Lorenz D., Hatter K., Park A., Sokatch J.R.
  29.      J. Biol. Chem. 267:13585-13592(1992).
  30. [ 3] Plunkett G. III, Burland V.D., Daniels D.L., Blattner F.R.
  31.      Nucleic Acids Res. 21:3391-3398(1993).
  32.